徐书华个人简历简介资料
徐书华
中国科学院特聘研究员
徐书华，万人计划/研究员。[1]徐书华是中国科学院特聘研究员，中国科学院和德国马普学会共同支持的青年科学家。他的主要研究领域是人类群体基因组学。
中文名徐书华
职业研究员
职称研究员
成果
研究方向：
群体基因组学是连接人类进化历史和药物遗传学以及基因治疗的桥梁。我们通过在群体水平进行大规模基因组学研究，了解遗传变异在群体内以及群体间的分布模式，以及弄清影响其分布模式的各种因素，并试图阐明遗传变异在群体和基因组水平的动态演化机制。同时，通过对基因组范围大量遗传变异的研究，揭示其一般性质；寻找到那些偏离基因组一般性质的遗传变异，建立起遗传变异与环境及致病因素的关联；并最终阐明遗传变异与表型变异以及与内外环境相互作用的关系和机制。[1]
获奖及荣誉：
[1]上海市科技启明星（2011）;[2]教育部科学研究优秀成果奖（自然科学奖）（一等）（第二完成人）（2011）;[3]全国优秀博士论文（2011）;[4]入选中国科学院青年创新促进会（2011）;[5]复旦大学优秀博士论文（2010.1）;[6]上海市优秀博士论文（2009.12）;[7]中国科学院卢嘉锡青年人才奖（2009-2014）;[8]赛诺菲-安万特（法国）－上海生科院优秀青年人才奖（2009);[9]明治乳业（日本）生命科学奖（2009）[1]
代表论著：
[1]Xiong Yang,Shuhua Xu*,The HUGO Pan-Asian SNP Consortium.2011.Identification of Close Relatives in the HUGO Pan-Asian SNP Database.PLoS One 6(12):e29502(10.1371/journal.pone.0029502).
[2]Wenfei Jin,Shuhua Xu*,Haifeng Wang,Yongguo Li,Yiping Shen,Bailin Wu,Li Jin*.2011.Genome-Wide Detection of Natural Selection in African Americans Pre-and Post-Admixture.Genome Research(doi:10.1101/gr.124784.111).
[3]Wenfei Jin,Pengfei Qin,Haiyi Lou,Li Jin*,Shuhua Xu*.2011.A Systematic Characterization of Genes Underlying both Complex and Mendelian Diseases.Hum.Mol.Genet.(doi:10.1093/hmg/DDR599).
[4]Haiyi Lou,Shilin Li,Yajun Yang,Longli Kang,Xin Zhang,Wenfei Jin,Bailin Wu,Li Jin*,Shuhua Xu*.2011.A Map of Copy Number Variations in Chinese Populations.PLoS One 6(11):e27341.
[5]Shuhua Xu*,Li Jin.2011.Chromosome-Wide Haplotype Sharing:A Measure Integrating Recombination Information to Reconstruct the Phylogeny of Human Populations.Ann.Hum.Genet.75(6):694-706.
[6]Shuhua Xu*,Shilin Li,Yajun Yang,Jingze Tan,Haiyi Lou,Wenfei Jin,Ling Yang,Xuedong Pan,Jiucun Wang,Yiping Shen,Bailin Wu,Hongyan Wang,Li Jin*.2011.A Genome-Wide Search for Signals of High Altitude Adaptation in Tibetans.Mol.Biol.Evol.28:1003-1011.
[7]Pankaj Jha,Swapnil Sinha,Kanika Kanchan,Tabish Qidwai,Ankita Narang,Prashant Kumar Singh,Sudhanshu S.Pati,Sanjib Mohanty,Saroj K.Mishra,Surya K.Sharma,Shally Awasthi,Vimala Venkatesh,Sanjeev Jain,Analabha Basu,Shuhua Xu,Indian Genome Variation Consortium,Mitali Mukerji,Saman Habib.2011.Deletion of the APOBEC3B gene strongly impacts susceptibility to falciparum malaria.Infection,Genetics and Evolution 12:142-148(10.1016/j.meegid.2011.11.001).
[8]Xiaoyun Cai,Zhendong Qin,Bo Wen,Shuhua Xu,Yi Wang,Yan Lu,Lanhai Wei,Chuanchao Wang,Shilin Li,Xingqiu Huang,Li Jin,Hui Li*,the Genographic Consortium.2011.Human Migration through Bottlenecks from Southeast Asia into East Asia during Last Glacial Maximum Revealed by Y Chromosomes.PLoS One 6(8):e24282.
[9]Chumpol Ngamphiw,Anunchai Assawamakin,Shuhua Xu,Philip J.Shaw,Jin Ok Yang,Ho Ghang,Jong Bhak,Edison Liu,Sissades Tongsima*,The HUGO Pan-Asian SNP Consortium.2011.PanSNPdb:The Pan-Asian SNP Genotyping Database.PLoS One 6(6):e21451.
[10]Wan Isa Hatin,Ab Rajab Nur-Shafawati,Mohd-Khairi Zahri,Shuhua Xu,Li Jin,Soon-Guan Tan,Mohammed Rizman-Idid,Bin Alwi Zilfalil,The HUGO Pan-Asian SNP Consortium.2011.Population Genetic Structure of Peninsular Malaysia Malay Sub-Ethnic Groups.PLoS One 6(4):e18312.
[11]Frederick Delfin,Jazelyn M Salvador,Gayvelline C Calacal,Henry B Perdigon,Kristina A Tabbada,Lilian P Villamor,Saturnina C Halos,Ellen Gunnarsdo´ttir,Sean Myles,David A Hughes,Shuhua Xu,Li Jin,Oscar Lao,Manfred Kayser,Matthew E Hurles,Mark Stoneking and Maria Corazon A De Ungria*.2011.The Y-chromosome landscape of the Philippines:extensive heterogeneity and varying genetic affinities of Negrito and non-Negrito groups.Eur.J.Hum.Genet.19:224-230.
[12]Shuhua Xu*,Sanchit Guputa and Li Jin*.2010.PEAS V1.0:A Package for Elementary Analysis of SNP Data.Mol.Ecol.Res.10:1085-1088.
[13]Shuhua Xu,Daoroong Kangwanpong,Mark Seielstad,Metawee Srikummool,Jatupol Kampuansai,Li Jin*.The HUGO Pan-Asian SNP Consortium.2010.Genetic Evidence Supports Linguistic Affinity of Mlabri—a Hunter-Gatherer Group in Thailand.BMC Genet.11:18.
[14]The HUGO Pan-Asian SNP Consortium(Co-corresponding author).2009.Mapping Genetic Diversity in Asia.Science 326:1541-1545.
[15]Shuhua Xu,Xianyong Yin,Shilin Li,Wenfei Jin,Haiyi Lou,Ling Yang,Xiaohong Gong,Hongyan Wang,Yiping shen,Xuedong Pan,Yungang He,Yajun Yang,Yi Wang,Wenqing Fu,Yu An,Jiucun Wang,Jingze Tan,Ji Qian,Xiaoli Chen,Xin Zhang,Yangfei Sun,Xuejun Zhang,Bailin Wu,Li Jin.2009.Genomic Dissection of Population Substructure of Han Chinese and Its Implication in Association Studies.Am.J.Hum.Genet.85:762-774.
[16]Shuhua Xu and Li Jin,2009.Response to Li et al.,Am.J.Hum.Genet.85:937-939.
[17]Shuhua Xu,Wenfei Jin,Li Jin.2009.Haplotype Sharing Analysis Showing Uyghurs Are Unlikely Genetic Donors.Mol.Biol.Evol.26:2197-2206.
[18]Shuhua Xu,Li Jin.2009.Computational Biology—Review and Prospects.Science(KEXUE).61(4):34-37.
[19]Yungang He,Shuhua Xu,Chuan Jia,Li Jin.2009.A design of multi-source samples as a shared control for association studies in genetically stratified populations.Cell Research 19:913-915.
[20]Shuhua Xu,Li Jin.2008.A Genome-wide Analysis of Admixture in Uyghurs and a High-Density Admixture Map for Disease-Gene Discovery.Am.J.Hum.Genet.83:322-336.
[21]Shuhua Xu,Wei Huang,Ji Qian,Li Jin.2008.Analysis of Genomic Admixture in Uyghur and Its Implication in Mapping Strategy.Am.J.Hum.Genet.82:883-894.
[22]Fuzhong Xue,Yi Wang,Shuhua Xu,Feng Zhang,Bo Wen,Xuesen Wu,Ming Lu,Ranjan Deka,Ji Qian,and Li Jin.2008.A spatial analysis of genetic structure of human populations in China reveals distinct difference between maternal and paternal lineages.Eur.J.Hum.Genet.16:705-717
[23]Shuhua Xu,Wei Huang,Haifeng Wang,Yungang He,Ying Wang,Yi Wang,Ji Qian,Momiao Xiong,Li Jin.2007.Dissecting Linkage Disequilibrium in African American Genomes:Roles of Markers and Individuals.Mol.Biol.Evol.24:2049-2058.[1]
人物访谈
科学家徐书华：研究亚洲人群基因组探秘人类进化奥秘
2018-11-26来源：中国新闻网郑莹莹
在亚太地区，很少有人像徐书华和他的团队这样，十几年来执着探索亚洲人群基因遗传和演化规律的[2]。
徐书华是中国科学院特聘研究员，中国科学院和德国马普学会共同支持的青年科学家。他的主要研究领域是人类群体基因组学。
徐书华是一个中国“土生土长”的科研人员，1978年出生的他说自己“生逢其时”，对于科研成长这个过程，内心充满感恩。
上世纪90年代，他从湖北的一个遥远山区走出来，1996年进入湖北大学，完成了大学和硕士研究生学习，而后到复旦大学攻读博士学位，2006年毕业后便进入中国科学院工作。
徐书华带领的研究组经过多年积累，系统研究了整个亚太地区人群的遗传多样性、迁移历史和适应性进化，研究水平居亚太前列。他介绍，长期以来，国际领域的生物医学和遗传进化研究都主要集中于欧美国家的人群，中国乃至亚洲的人群受关注度相对小得多，研究缺乏长期的、系统的积累。本土的人类群体研究在国际领域也未形成与中国综合国力相匹配的规模和地位，因此这也是他的团队和合作者们正在努力的方向。
徐书华介绍，在学术界，他的团队第一个利用前沿的基因组技术和计算分析手段，在基因组水平上研究了西藏藏族高原人群的系统演化历史，“我们研究了一系列人群，包括：新疆的维吾尔族，西藏的藏族等一批在亚洲人群遗传演化中具有重要地位的族群。”
此外，周边国家和地区的人群，包括南亚的印度、巴基斯坦、斯里兰卡，东南亚的马来西亚、菲律宾，以及中东的阿拉伯国家等等，徐书华的团队都有长期关注。
徐书华团队尝试阐明这些人群的遗传背景以及基因组多样性形成机制，比如：“这些人怎么来的，他们为何会出现，当中经历了什么，为什么会携带这些遗传变异？”
“搞清楚这些问题，不仅能让我们了解人类族群的演化历史，而且有助于我们理解人类基因组序列的功能和表型意义。有很多遗传变异你只能在一些特定的少数族群中才有可能观察到，继而进行研究。”他说。
徐书华介绍，基因组学跟语言学、民族关系等领域紧密关联，群体基因组学的研究不仅能追溯“我是谁，我从哪里来”，还对现实的人类健康有重要的参考意义。通过回溯族群的“基因史”，了解多样化人群演化的来龙去脉，复杂的遗传疾病可以得到更好的理解，从而为精准医学奠定群体遗传学基础。
“今后的精准是建立在大数据基础上的，过去一种病全世界的人可能用一种药，未来根据群体或个人基因组的不同，药也需不同，比如汉族和少数民族吃的药不同，南方人和北方人吃的药也不同，甚至上海和浙江的居民吃的药都不同。今后的目标是不断精确，精确到一个特定的小群体，最终可能一直精确到‘量身定制’的个性化医疗。”徐书华说。
伴随中国科研实力的总体提升，本土也涌现一批优秀科研人才。作为本土成长起来的科研人才，徐书华说，希望中国能给本土科研人员创造良好的成长土壤，给他们持续、稳定的支撑，让他们的科研事业能有更多上升的通道、成长的空间。
今后的人生路，徐书华说，很多研究尚在半途中，未来还有很长一段路要走，“至少要10年，才能将前面积累的数据以及不断增长中的信息，逐步消化，转变为知识。”
他有个理想，就是把一个个族群的遗传背景、起源和演化历史研究清楚，建立并解析“中华民族基因库”，为中国乃至世界的生命与医学研究做一些基础性工作。
参考资料
1徐书华个人简历．中科院[引用日期2016-02-21]
2科学家徐书华：研究亚洲人群基因组探秘人类进化奥秘．中国科学院．2018-11-26[引用日期2020-04-20]
3徐书华．生命科学与技术学院[引用日期2023-03-09]
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